XIE/Enzyme:2025/Nov: Difference between revisions

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== 日期 11.5 ==
== 日期 11.5 ==
* '''S1-GDH 杂交'''
* '''S1-GDH 杂交——超滤与否'''
#反应1:取 '''30 ul GDH '''溶液,加入 '''PBS 90 ul'''稀释, 取 '''100 ul 加入 1 ul DBCO''' 反应,剩余作为 '''对照''' 避光孵育
#反应1:取 '''30 ul GDH '''溶液,加入 '''PBS 90 ul'''稀释, 取 '''100 ul 加入 1 ul DBCO''' 反应,剩余作为 '''对照''' 避光孵育
#将样品平均分为两份(超滤、不超滤),超滤组 12000 转 20 min
#反应2:分别向以上两组样品中各加入 5 ul S1 避光孵育过夜
*''' S1-GDH 杂交——中间体验证'''
#反应1:取 '''30 ul GDH '''溶液,加入 '''PBS 90 ul'''稀释, 取 '''100 ul 加入 1 ul DBCO''' 反应,剩余作为 '''对照''' 避光孵育4 h
#中产物:保留样品 '''20 ul''',剩余 '''80 ul,12000 转 20 min '''超滤
#反应2:吸出超滤液,少量多次清洗滤管,收集清洗液并保持体积为''' 80 ul ''','''加入 S1 8 ul '''孵育过夜

Revision as of 11:12, 5 November 2025

日期 11.3

1. GDH

GDH 1.4 mg,溶解于 2 mL PBS (1×) 中,形成 20 μM 溶液。 分装于离心管(每管 30 μL,共 4 管),以及 EP 管(400 μL、600 μL、800 μL 各一管)。 取其中 30 ul 管,加入 90 mL PBS (1×, 5 μM)。 取 100 μL 作为待反应液,剩余 20 μL 作为凝胶对照液。

2. DBCO

称取 DBCO 5 mg,加入 50 μL DMF (100 mM) 溶解。 取 2 μL 稀释至 20 μL (10 mM)

3. Oligo

分别向 Seq1Seq2 中加入UP 水:

  • Seq1: 124 μL (1 mM)
  • Seq2: 79 μL (1 mM)

各分装离心管 3 支,每支 20 μL

4.反应

  1. DBCO 溶液(10 mM) 1 ul 加入待反应溶液,室温下,抽屉内避光孵育 5 h
  2. 反应后的溶液,超滤离心 2000 转 3 min 25 ℃ , 吸取离心后上清液并稀释至 90 ul ,二次清洗液 90 ul
  3. 加入 Seq1 (1 mM) 10 ul 于上清液中,抽屉中孵育过夜

日期 11.4

600X

1. nativepage

  • 制胶:配置胶液 1 X TBE 溶液
  • 上样:上样前 吹去孔中杂质,上样 7 孔(Marker、纯蛋白液、样品液、超滤洗液、Marker 、蛋白缓冲、蛋白缓冲)
  • 跑胶:120 V

2. 考马斯亮蓝染色

  1. 切取胶体,于培养皿中注入 10 ml 考马斯亮蓝37 ℃ 摇床振摇 3 h
  2. 吸出培养皿中的考马斯亮蓝溶液,置于 15 ml 离心管 4°存储备用;用 UP 水反复清洗胶体基底至原色

总结 1. 超滤时间过短,未有滤液 2. TBE 溶液 未调 PH 3. 用枪混乱,量不准

日期 11.5

  • S1-GDH 杂交——超滤与否
  1. 反应1:取 30 ul GDH 溶液,加入 PBS 90 ul稀释, 取 100 ul 加入 1 ul DBCO 反应,剩余作为 对照 避光孵育
  2. 将样品平均分为两份(超滤、不超滤),超滤组 12000 转 20 min
  3. 反应2:分别向以上两组样品中各加入 5 ul S1 避光孵育过夜
  • S1-GDH 杂交——中间体验证
  1. 反应1:取 30 ul GDH 溶液,加入 PBS 90 ul稀释, 取 100 ul 加入 1 ul DBCO 反应,剩余作为 对照 避光孵育4 h
  2. 中产物:保留样品 20 ul,剩余 80 ul,12000 转 20 min 超滤
  3. 反应2:吸出超滤液,少量多次清洗滤管,收集清洗液并保持体积为 80 ul 加入 S1 8 ul 孵育过夜