XIE/Enzyme:2025/Nov: Difference between revisions
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=== PB 缓冲组 === | === PB 缓冲组 === | ||
Revision as of 10:56, 14 November 2025
日期 11.3
1. GDH
取 GDH 1.4 mg,溶解于 2 mL PBS (1×) 中,形成 20 μM 溶液。 分装于离心管(每管 30 μL,共 4 管),以及 EP 管(400 μL、600 μL、800 μL 各一管)。 取其中 30 ul 管,加入 90 mL PBS (1×, 5 μM)。 取 100 μL 作为待反应液,剩余 20 μL 作为凝胶对照液。
2. DBCO
称取 DBCO 5 mg,加入 50 μL DMF (100 mM) 溶解。 取 2 μL 稀释至 20 μL (10 mM)。
3. Oligo
分别向 Seq1、Seq2 中加入UP 水:
- Seq1: 124 μL (1 mM)
- Seq2: 79 μL (1 mM)
各分装离心管 3 支,每支 20 μL。
4.反应
- 取 DBCO 溶液(10 mM) 1 ul 加入待反应溶液,室温下,抽屉内避光孵育 5 h
- 反应后的溶液,超滤离心 2000 转 3 min 25 ℃ , 吸取离心后上清液并稀释至 90 ul ,二次清洗液 90 ul
- 加入 Seq1 (1 mM) 10 ul 于上清液中,抽屉中孵育过夜
日期 11.4

1. nativepage
- 制胶:配置胶液(浓度9%) 1 X TBE 溶液
- 上样:上样前 吹去孔中杂质,上样 7 孔(Marker、纯蛋白液、样品液、超滤洗液、Marker 、蛋白缓冲、蛋白缓冲)
- 跑胶:120 V
2. 考马斯亮蓝染色
- 切取胶体,于培养皿中注入 10 ml 考马斯亮蓝 ,37 ℃ 摇床振摇 3 h
- 吸出培养皿中的考马斯亮蓝溶液,置于 15 ml 离心管 4°存储备用;用 UP 水反复清洗胶体基底至原色。
总结 1. 超滤时间过短,未有滤液 2. TBE 溶液 未调 PH 3. 用枪混乱,量不准
日期 11.5
- S1-GDH 杂交——超滤与否
- 反应1:取 30 ul GDH 溶液,加入 PBS 90 ul稀释, 取 100 ul 加入 1 ul DBCO 反应,剩余作为 对照 1 避光孵育
- 将样品平均分为两份(超滤组、未滤组),超滤组 12000 转 20 min
- 反应2:分别向以上两组样品中各加入 5 ul S1 避光孵育过夜
- S1-GDH 杂交——中间体验证
- 反应1:取 30 ul GDH 溶液,加入 PBS 90 ul稀释, 取 100 ul 加入 1 ul DBCO 反应,剩余作为 对照 2' 避光孵育4 h
- 中产物:,样品 12000 转 20 min 超滤 ,保留样品 20 ul作为 中间产物对照
- 反应2:吸出超滤液,少量多次清洗滤管,收集清洗液并保持体积为 80 ul ,加入 S1 8 ul 孵育过夜
日期 11.6
- Native page 验证
- 配置胶液(浓度7.5%-Acr 2 ml)、1X TEB 1.5 L溶液
- 跑胶 120 V 8 孔(对照1、未滤组、超滤组、Marker 、Marker、对照2、中间产物、样品)
- 考马斯亮蓝染色

日期 11.10
- RuCHMO - S2
- 稀释 RuCHMO :取RuCHMO原液 100 ul,用PB Buffer稀释至 564 ul(5 uM),分至 4 管 每管140 ul
- 反应 1:取 1 管 RuCHMO ,吸取 '100 ul ,加入 1 ul DBCO 溶液.剩余作为空白对照,在4℃,冰浴条件下孵育 4 h
- 超滤 :4℃ 12000 转 超滤 20 min ,清洗并稀释至 90 ul
- 反应 2:向样品溶液中加入 10 ul S2, 4℃ 冰浴 过夜
日期 11.11
- Native page 验证
- 配置胶液(浓度7.5%-Acr 2 ml)、1X TEB 1.5 L溶液
- 跑胶 120 V 5 孔(Marker、样品、对照1、对照2 、Marker)
- 考马斯亮蓝染色

日期 11.12
- RuCHMO - S2
- 反应 1:取 1 管 RuCHMO ,吸取 '100 ul ,加入 1 ul DBCO 溶液.剩余作为空白对照,在4℃,冰浴条件下孵育 4 h
- 超滤 :4℃ 12000 转 超滤 20 min ,清洗并稀释至 100 ul,取 30 ul 保留作为 中间体对照
- 反应 2:向剩余溶液中加入 10 ul S2, 4℃ 冰浴 过夜
日期 11.13
- Native page 验证
- 配置胶液(浓度7.5%-Acr 2 ml)、1X TEB 1.5 L溶液
- 跑胶 120 V 5 孔(Marker、对照、样品、中间体 、Marker)

日期 11.15
- RuCHMO-S2 蛋白条带消失原因
- 分组
PBS 缓冲组
| -80° 保存 | 常规对照 | 未超滤组 | 超滤组 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| 中间体 | 终产物 | 中间体 | 终产物 | ||
| C1 | C2 | M1 | R1 | M2 | R2 |
PB 缓冲组
| -80° 保存 | 常规对照 | 未超滤组 | 超滤组 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| 中间体 | 终产物 | 中间体 | 终产物 | ||
| C1' | C2' | M1' | R1' | M2' | R2' |